Авторизуемся в SSH-клиенте (например, putty),

Переходим в каталог private:

cd private

Качаем необходимые модуль с cpan.org, командой (пример модуля, GD-2.45 ):

wget http://search.cpan.org/CPAN/authors/id/L/LD/LDS/GD-2.45.tar.gz

Распаковываем командой:

tar -xzf GD-2.45.tar.gz

Переходим в папку с модулем:

cd GD-2.45

Устанавливаем:

perl Makefile.PL PREFIX=~/private/modules make make test make install

В вашем скрипте после этого необходимо добавить:

use lib qw(/home/httpd/vhosts/domain.ru/private/modules /home/httpd/vhosts/domain.ru/private/modules/lib /home/httpd/vhosts/domain.ru/private/modules/lib64 /home/httpd/vhosts/domain.ru/private/modules/lib64/perl5/site_perl /home/httpd/vhosts/domain.ru/private/modules/lib64/perl5 /home/httpd/vhosts/domain.ru/private/modules/lib/perl5/site_perl /home/httpd/vhosts/domain.ru/private/modules/lib/perl5);